Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

- m -

• makeDataPointCstSPtr() : pappso::DataPoint
• makeFastaFileIndexerSPtr() : pappso::FastaFileIndexer
• makeGrpGroupSp() : pappso::GrpGroup
• makeGrpSubGroupSp() : pappso::GrpSubGroup
• makeMapTraceCstSPtr() : pappso::MapTrace
• makeMapTraceSPtr() : pappso::MapTrace
• makeMassSpectrumCstSPtr() : pappso::MassSpectrum
• makeMassSpectrumSPtr() : pappso::MassSpectrum
• makeMsRunSliceSp() : pappso::MsRunSlice
• makeNoConstPeptideSp() : pappso::Peptide
• makePeptideFragmentIonListBaseSp() : pappso::PeptideFragmentIonListBase
• makePeptideFragmentIonSp() : pappso::PeptideFragmentIon
• makePeptideNaturalIsotopeAverageSp() : pappso::PeptideNaturalIsotopeAverage
• makePeptideNaturalIsotopeListSp() : pappso::PeptideNaturalIsotopeList
• makePeptideSp() : pappso::Peptide
• makeProteinSp() : pappso::Protein
• makeQualifiedMassSpectrumCstSPtr() : pappso::QualifiedMassSpectrum
• makeQualifiedMassSpectrumSPtr() : pappso::QualifiedMassSpectrum
• makeTraceCstSPtr() : pappso::Trace
• makeTracePeakCstSPtr() : pappso::TracePeak
• makeTraceSPtr() : pappso::Trace
• makeXicCstSPtr() : pappso::Xic
• makeXicSPtr() : pappso::Xic
• manageSideAccess() : pappso::spectree::SpecTree
• mapScanNumberPrecursor() : pappso::masschroq::PrecursorParser
• mapSpectrumIndexToPrecursor() : pappso::masschroq::PrecursorParser
• MapTrace() : pappso::MapTrace
• maskMs1() : pappso::MzxmlOutput
• MassDataCombinerInterface() : pappso::MassDataCombinerInterface
• massDeconvolutionSignal() : pappso::MassSpecTracePlotWidget
• MassSpecTracePlotContext() : pappso::MassSpecTracePlotContext
• MassSpecTracePlotWidget() : pappso::MassSpecTracePlotWidget
• MassSpectrum() : pappso::MassSpectrum
• MassSpectrumCombiner() : pappso::MassSpectrumCombiner
• massSpectrumCstSPtr() : pappso::BafAsciiMsRunReader, pappso::MsRunReader, pappso::PwizMsRunReader, pappso::TimsFramesMsRunReader, pappso::TimsMsRunReader, pappso::TimsMsRunReaderDia, pappso::TimsMsRunReaderMs2, pappso::TimsMsRunReaderMs2Selected, pappso::XyMsRunReader
• massSpectrumFilter() : pappso::MassSpectrum
• MassSpectrumFilterGreatestItensities() : pappso::MassSpectrumFilterGreatestItensities
• MassSpectrumFilterResampleKeepMzRange() : pappso::MassSpectrumFilterResampleKeepMzRange
• MassSpectrumFilterResampleRemoveMzRange() : pappso::MassSpectrumFilterResampleRemoveMzRange
• MassSpectrumId() : pappso::MassSpectrumId
• massSpectrumIndex() : pappso::MsRunDataSetTree
• MassSpectrumJs() : pappso::MassSpectrumJs
• MassSpectrumMinusCombiner() : pappso::MassSpectrumMinusCombiner
• MassSpectrumPlusCombiner() : pappso::MassSpectrumPlusCombiner
• massSpectrumSPtr() : pappso::BafAsciiMsRunReader, pappso::MsRunReader, pappso::PwizMsRunReader, pappso::TimsFramesMsRunReader, pappso::TimsMsRunReader, pappso::TimsMsRunReaderDia, pappso::TimsMsRunReaderMs2, pappso::TimsMsRunReaderMs2Selected, pappso::XyMsRunReader
• MassSpectrumWidget() : pappso::MassSpectrumWidget
• match() : pappso::ProteinIntegerCode
• matchExperimentalPeaks() : pappso::specglob::PeptideModel
• matchPeak() : pappso::PeptideInterface, pappso::PeptideNaturalIsotopeAverage
• maxCount() : pappso::GrpSubGroup
• maxIntensityDataPoint() : pappso::MassSpectrum
• maxX() : pappso::Trace
• maxXDataPoint() : pappso::Trace
• maxY() : pappso::Trace
• maxYDataPoint() : pappso::Trace
• mbrDetectQuantifyPeaks() : pappso::masschroq::MsRunPeptideList
• MbrPeptideMeasurements() : pappso::masschroq::MbrPeptideMeasurements
• merge() : pappso::GrpSubGroup, pappso::ProjectParameters
• mergeParameterMap() : pappso::cbor::psm::PsmFileAppend
• MgfOutput() : pappso::MgfOutput
• minIntensityDataPoint() : pappso::MassSpectrum
• minX() : pappso::Trace
• minXDataPoint() : pappso::Trace
• minY() : pappso::Trace
• minYDataPoint() : pappso::Trace
• modifCount() : pappso::specglob::PeptideModel
• MorpheusScore() : pappso::MorpheusScore
• mouseMoveEvent() : pappso::QCPSpectrum, pappso::QCPXic
• mouseMoveHandler() : pappso::BasePlotWidget, pappso::DriftSpecMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::DriftSpecTracePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mouseMoveHandlerDraggingCursor() : pappso::BasePlotWidget, pappso::DriftSpecMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::DriftSpecTracePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mouseMoveHandlerLeftButtonDraggingCursor() : pappso::BasePlotWidget
• mouseMoveHandlerNotDraggingCursor() : pappso::BasePlotWidget, pappso::DriftSpecMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::DriftSpecTracePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mouseMoveHandlerRightButtonDraggingCursor() : pappso::BasePlotWidget
• mousePressEvent() : pappso::HttpButton, pappso::QCPSpectrum, pappso::QCPXic
• mousePressEventSignal() : pappso::BasePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mousePressHandler() : pappso::BasePlotWidget, pappso::DriftSpecMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::DriftSpecTracePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mousePseudoButtonKeyPressEvent() : pappso::BasePlotWidget
• mousePseudoButtonKeyReleaseEvent() : pappso::BasePlotWidget
• mouseReleaseEvent() : pappso::QCPSpectrum, pappso::QCPXic
• mouseReleaseEventSignal() : pappso::BasePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mouseReleaseHandler() : pappso::BasePlotWidget, pappso::DriftSpecMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::DriftSpecTracePlotWidget, pappso::MassSpecTracePlotWidget, pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget, pappso::TicXicChromTracePlotWidget
• mouseReleaseHandlerLeftButton() : pappso::BasePlotWidget
• mouseReleaseHandlerRightButton() : pappso::BasePlotWidget
• mouseWheelEventSignal() : pappso::BasePlotWidget
• mouseWheelHandler() : pappso::BasePlotWidget
• moveLinearReadForward() : pappso::TimsBinDec
• moveMouseCursorGraphCoordToGlobal() : pappso::BasePlotWidget
• moveMouseCursorPixelCoordToGlobal() : pappso::BasePlotWidget
• ms2ReaderGenerateMS1MS2Spectrum() : pappso::TimsDdaPrecursors
• ms2ReaderSpectrumCollectionByMsLevel() : pappso::TimsDdaPrecursors
• msDataFormatAsString() : pappso::Utils
• MsFileAccessor() : pappso::MsFileAccessor
• MsFileReader() : pappso::MsFileReader
• MsRun() : pappso::masschroq::MsRun
• MsRunDataSetTree() : pappso::MsRunDataSetTree
• MsRunDataSetTreeNode() : pappso::MsRunDataSetTreeNode
• MsRunGroup() : pappso::masschroq::MsRunGroup
• MsRunId() : pappso::MsRunId
• MsRunPeptideList() : pappso::masschroq::MsRunPeptideList
• MsRunQualifiedSpectrumLoader() : pappso::MsRunQualifiedSpectrumLoader
• MsRunReadConfig() : pappso::MsRunReadConfig
• MsRunReader() : pappso::MsRunReader
• MsRunReaderRetentionTimeLine() : pappso::MsRunReaderRetentionTimeLine
• MsRunReaderScanNumberMultiMap() : pappso::MsRunReaderScanNumberMultiMap
• msRunReaderSPtr() : pappso::MsFileAccessor
• msRunReaderSPtrForSelectedMsRunId() : pappso::MsFileAccessor
• MsRunReaderTicChromatogram() : pappso::MsRunReaderTicChromatogram
• MsRunRetentionTime() : pappso::MsRunRetentionTime< T >
• MsRunSlice() : pappso::MsRunSlice
• MsRunXicExtractor() : pappso::MsRunXicExtractor
• MsRunXicExtractorDisk() : pappso::MsRunXicExtractorDisk
• MsRunXicExtractorDiskBuffer() : pappso::MsRunXicExtractorDiskBuffer
• MsRunXicExtractorFactory() : pappso::MsRunXicExtractorFactory
• MsRunXicExtractorInterface() : pappso::MsRunXicExtractorInterface
• MsRunXicExtractorReadPoints() : pappso::MsRunXicExtractor::MsRunXicExtractorReadPoints
• multiplyBy() : pappso::XicCoord, pappso::XicCoordTims
• MzCalibrationInterface() : pappso::MzCalibrationInterface
• MzCalibrationModel1() : pappso::MzCalibrationModel1
• MzCalibrationModel1Cached() : pappso::MzCalibrationModel1Cached
• MzCalibrationStore() : pappso::MzCalibrationStore
• mzChanged() : pappso::MassSpectrumWidget
• mzChangeEvent() : pappso::MassSpectrumWidget
• MzIdentMlWriter() : pappso::MzIdentMlWriter
• MzIntegrationParams() : pappso::MzIntegrationParams
• MzRange() : pappso::MzRange
• MzxmlOutput() : pappso::MzxmlOutput