Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- t -
- tandemProgressMessage() : pappso::TandemWrapperRun
 
- TandemWrapperRun() : pappso::TandemWrapperRun
 
- temporaryFile : pappso::cbor::psm::PsmFileAppend::SampleStorage
 
- tic() : pappso::MassSpectrum
 
- TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget() : pappso::TicXicChromDriftSpecColorMapPlotWidget
 
- TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget() : pappso::TicXicChromMassSpecColorMapPlotWidget
 
- TicXicChromTracePlotWidget() : pappso::TicXicChromTracePlotWidget
 
- tims_calibration_id : pappso::TimsFrameRecord
 
- tims_frame_list : pappso::TimsDdaPrecursors::SpectrumDescr
 
- tims_offset : pappso::TimsFrameRecord
 
- TimsBinDec() : pappso::TimsBinDec
 
- TimsData() : pappso::TimsData, pappso::TimsDdaPrecursors, pappso::TimsXicExtractorInterface
 
- TimsDataFastMap() : pappso::TimsDataFastMap
 
- TimsDdaPrecursors : pappso::TimsData, pappso::TimsDdaPrecursors
 
- TimsDiaSlices : pappso::TimsData, pappso::TimsDiaSlices
 
- TimsDirectXicExtractor() : pappso::TimsDirectXicExtractor, pappso::TimsFrame
 
- TimsFrame() : pappso::TimsFrame
 
- TimsFrameBase() : pappso::TimsFrameBase
 
- TimsFrameMobilityTraces() : pappso::TimsFrameMobilityTraces
 
- TimsFrameRawDataChunck() : pappso::TimsFrameRawDataChunck
 
- TimsFramesMsRunReader() : pappso::TimsFramesMsRunReader
 
- TimsFrameType1() : pappso::TimsFrameType1
 
- TimsMs2CentroidFilter() : pappso::TimsMs2CentroidFilter
 
- TimsMsFileReader() : pappso::TimsMsFileReader
 
- TimsMsRunReader() : pappso::TimsMsRunReader
 
- TimsMsRunReaderBase() : pappso::TimsMsRunReaderBase
 
- TimsMsRunReaderDia() : pappso::TimsMsRunReaderDia
 
- TimsMsRunReaderMs2() : pappso::TimsMsRunReaderMs2
 
- TimsMsRunReaderMs2Selected() : pappso::TimsMsRunReaderMs2Selected
 
- TimsXicExtractorInterface() : pappso::TimsXicExtractorInterface
 
- tmpIntensity : pappso::TimsFrame::XicComputeStructure
 
- toAbsoluteString() : pappso::Aa, pappso::Peptide
 
- tof_index : pappso::TimsFrameBase::TofIndexIntensityPair
 
- tofIndexList : pappso::TimsDataFastMap
 
- toJsonObject() : pappso::ProjectParam, pappso::ProjectParameters
 
- toMap() : pappso::Trace, pappso::TraceJs
 
- toProForma() : pappso::Aa, pappso::AaModification, pappso::Peptide, pappso::specglob::PeptideModel
 
- toQPaintDevice() : GraphicDeviceWidget, pappso::MassSpectrumWidget, pappso::XicWidget
 
- toShort4PointsString() : pappso::SelectionPolygon
 
- toString() : pappso::Aa, pappso::BasePlotContext, pappso::ChemicalFormula, pappso::ColorMapPlotConfig, pappso::DaltonPrecision, pappso::DataPoint, pappso::DataPointJs, pappso::DeepProtEnumStr, pappso::FilterCeilingAmplitudePercentage, pappso::FilterChargeDeconvolution, pappso::FilterComplementIonEnhancer, pappso::FilterFloorAmplitudePercentage, pappso::FilterLowIntensitySignalRemoval, pappso::FilterMorphoAntiSpike, pappso::FilterMorphoBackground, pappso::FilterMorphoMean, pappso::FilterMorphoWindowBase, pappso::FilterMzExclusion, pappso::FilterNameInterface, pappso::FilterNormalizeIntensities, pappso::FilterQuantileBasedRemoveY, pappso::FilterRemoveY, pappso::FilterSavitzkyGolay, pappso::FilterSuiteString, pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::IntegrationScopeSpec, pappso::IsotopeCount, pappso::MapTrace, pappso::MassSpecTracePlotContext, pappso::MassSpectrumId, pappso::MsDataFormatEnumStr, pappso::MsRunDataSetTreeNode, pappso::MsRunId, pappso::MsRunReadConfig, pappso::MzIntegrationParams, pappso::MzRange, pappso::PeakIonIsotopeMatch, pappso::PeakIonMatch, pappso::Peptide, pappso::PeptideNaturalIsotopeAverage, pappso::PpmPrecision, pappso::PrecisionBase, pappso::QualifiedMassSpectrum, pappso::ResPrecision, pappso::SavGolParams, pappso::SelectionPolygon, pappso::SelectionPolygonSpec, pappso::specglob::ExperimentalSpectrum, pappso::specglob::PeptideModel, pappso::spectree::SpecTree, pappso::Trace, pappso::Utils, pappso::XicCoord, pappso::XicCoordTims
 
- toSvgFile() : GraphicDeviceWidget
 
- totalIonCurrent() : pappso::MassSpectrum
 
- toTrace() : pappso::BaseTracePlotWidget, pappso::MapTrace
 
- toUtf8StandardString() : pappso::Utils
 
- toXmlDouble() : pappso::MzIdentMlWriter
 
- toXmlMass() : pappso::MzIdentMlWriter
 
- toXmlMassDelta() : pappso::MzIdentMlWriter
 
- Trace() : pappso::Trace
 
- TraceCIter : pappso::FilterLowIntensitySignalRemoval
 
- TraceCombiner : pappso::Trace, pappso::TraceCombiner
 
- TraceDetectionMoulon() : pappso::TraceDetectionMoulon
 
- TraceDetectionZivy() : pappso::TraceDetectionZivy
 
- TraceJs() : pappso::TraceJs
 
- TraceMinusCombiner : pappso::Trace, pappso::TraceMinusCombiner
 
- TracePeak() : pappso::TracePeak
 
- TracePeakList() : pappso::TracePeakList
 
- TracePlusCombiner : pappso::Trace, pappso::TracePlusCombiner
 
- transformToMonoChargedForAllDataPoint() : pappso::FilterChargeDeconvolution
 
- translateAaModificationFromUnimod() : pappso::Utils
 
- translateAligned2OriginalRetentionTime() : pappso::MsRunRetentionTime< T >
 
- translateOriginal2AlignedRetentionTime() : pappso::MsRunRetentionTime< T >
 
- Translater() : pappso::MzxmlOutput::Translater
 
- translateXicCoordFromTo() : pappso::IonMobilityGrid
 
- transpose() : pappso::IntegrationScope, pappso::IntegrationScopeBase, pappso::IntegrationScopeRect, pappso::IntegrationScopeRhomb, pappso::SelectionPolygon
 
- transposeAxes() : pappso::BaseColorMapPlotWidget
 
- tree : pappso::specpeptidoms::Location
 
- tree_id : pappso::specpeptidoms::KeyCell
 
- tryBetterPositionOffsets() : pappso::specglob::PostTreatment
 
- tryToCumulateOffSets() : pappso::specglob::PostTreatment
 
- tryToRemoveOffsets() : pappso::specglob::PostTreatment
 
- twofft() : pappso::FilterSavitzkyGolay
 
- type : InHousePolynomialSolverResult, pappso::specglob::ExperimentalSpectrumDataPoint